Plateforme biofilms et microbiomes

Plateforme biofilms et microbiomes

La plateforme biofilms et microbiome contribue à l’étude du rôle du microbiome marin dans la protection des animaux marin. Des prélèvement in situ d'échantillon et la culture des souches afin de les cribler contre des pathogènes peuvent être menés. Les composés anti microbiens sont isolés puis étudiés pour des applications en aquaculture (probiotique) et en santé.

Offre de compétences

• Avec une approche biologique
  • Isolement et identification de souche bactériennes – Méthode moléculaire par ARN 16S (RT-PCR)
  • Caractérisation du niveau d’expression d’un gène (q-PCR)
• Avec une approche analytique
• Purification de peptides et de protéines (LC-DAD)
• Dosage de peptides et de protéines (LC-DAD)
• Caractérisation et dosage de peptides, de protéines et de métabolites bactériens issues de bactéries marines (LC-Dual λ)
• Dosage enzymatique (spectrophotometre UV)
• Dosage des protéines totales (taux d’azote) (Kjeldahl)
• Analyse de métabolites bactériens (MALDI-TOF) (2022/2023) CPER
• Analyse et comparaison de protéines à l’aide d’une banque de données (MALDI-TOF) (2022/2023) CPER
• Purification de peptides, de protéines et de métabolites bactériens (LC-DEDL) (2022)
• Criblage anti-bactérien (LC-DEDL)

Équipements

Le LBCM, pour me mener à bien ces analyses, bénéficie d'équipements spécifiques.